Syphon Filter: The Omega Strain

Das Spiel beginnt in Carthage, Michigan, wo Imani Gray und vier IPCA-Rekruten losgeschickt werden, um Lawrence Mujari zu finden und die Bedrohung durch die französische Anarchistische Befreiungsarmee (ALA) auszuschalten, während Gabriel Logan und Lian Xing in Uganda und Gary Stoneman in Italien ermitteln. Die IPCA-Agenten vereiteln die Pläne der ALA. Mujari wird geborgen und medizinisch versorgt. In der Zwischenzeit findet Stone heraus, dass die Cosa Nostra das Virus zurückholen will, um es als Werkzeug in Mafiakriegen einzusetzen. Also begibt sich Stone auf eine Mission nach Pescara, um den Mafiaboss Dimitri Alexoupolos zu ermorden. Dimitris Ermordung verhinderte, dass eine Mafiafamilie Zugang zu Syphon Filter bekam.